Eğer IIS'de yeni bir Application oluştururken bu hatayı alıyorsanız,hatanın büyük bir ihtimalle nedeni mevcut olmayan bir Application Pool'un bir veya birkaç site/Aplication'a atanmış olmasıdır.
Benim başıma gelen olayda DefaultAppPool'u sildikten sonra almaya başlamıştım hatayı.
Meğerse yukarda görüldüğü üzere Web Sites' in de özellikleri varmış ve Application Pool olarak DefaultAppPool gözüküyor ve sürekli disabled durumda.Benim IIS de ise invalid_application_pool yazıyordu ve muhtemelen sizdede bu şekilde kalmış bir Application Pool olacaktır.